In Emden sind einige Behördenschiffe anzutreffen. Überwiegend liege diese im Aussenhafen gegenüber vom Borkumkai.

Die Hafenschlepper werden überwiegend von der Reederei Emder Schlepp- Betrieb GmbH gestellt. Diese liegen im Aussenhafen gegenüber vom Borkumkai.

Passagierschiffe von Emden fahren fast ausschließlich nach Borkum. Die schnelle Verbindung wird entweder durch die NORDLICHT oder die NORDLICHT II sichergestwellt.

Die Autofähren MÜNSTERLAND, OSTFRIESLAND und WESTFALEN fahren von Emden bzw. Eemshaven nach Borkum.

In Emden gehören Autotransporter zum Stadtbild. Die hohen Schiffe überragen das flache Land und die meisten Gebäude. Regelmäßige Besucher sind die KESS Autotransporter MALACCA HIGHWAY und THAMES HIGHWAY aber auch die PATARA und die CITY OF ST. PETERSBURG sind regelmäßig im Hafen anzutreffen. Die ganz großen Autofrachter, die Weltweit in Fahrt sind, kommen in größeren Abständen nach Emden (ODIN HIGHWAY, EMDEN, WOLFSBURG oder auch SIEM CONFUCIUS als Beispiel). Oftmals sind es Volkswagen aus dem Werk in Emden, die Weltweit verschifft werden.

Neben kleineren Frachtschiffen sind im Emder Hafen auch oftmals Schiffe für den Transport von Rotoren von Windkraftanlagen anzutreffen. Das Frachtschiff E-SHIP I ist seit Jahren regelmäßiger Gast in Emden.

Emden ist ein großer deutscher Offshoreversorger- Hafen. SO gut wie immer sind dort meist gleich mehrere Offshoreversorger und Offshore- Spezialschiffe anzutreffen. Beispiele dafür sind die ACE SUPPLIER oder die ESVAGT BREEZE.